Tylko organ podatkowy może wstrzymać bieg przedawnienia
31.07.2025 | PODATKI
Naczelny Sąd Administracyjny rozstrzygnął, że to nie strony prywatne – czyli podatnik lub jego kontrahent – ale wyłącznie organ podatkowy może zawiesić bieg terminu przedawnienia, poprzez skierowanie sprawy do sądu powszechnego. Jeśli spór cywilny został wszczęty przez przedsiębiorców, bez udziału organu podatkowego, nie wpływa on na bieg ustawowego, pięcioletniego terminu odliczenia podatku VAT.
Sprawa dotyczyła kontraktu budowlanego z 2015 roku, gdzie wystawiono fakturę końcową, której kwota była przedmiotem sporu. Przedsiębiorca wystąpił przeciwko podwykonawcy do sądu cywilnego, który ostatecznie w marcu 2021 roku stwierdził, że faktura wystawiona przez drugi z podmiotów zawiera zawyżone koszty wykonanych prac.
Przedsiębiorca zlecający prace podwykonawcy utrzymywał, że w związku z toczącym się postępowaniem bieg terminu przedawnienia został zawieszony, a on sam ma prawo skorygować deklaracje VAT i podatku dochodowego z wystawionej w 2015 roku faktury. Argumentował on, że proces cywilny, w którym ustalano wysokość wystawionych przez podwykonawcę faktur zawiesił bieg przedawnienia na mocy art. 70 § 6 pkt 3 Ordynacji podatkowej.
Z taką tezą nie zgodził się Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej twierdząc, że wyłącznie czynności prawne podejmowane przez organy podatkowe wywierają skutek przewidziany w art. 70 § 6 pkt 3 ordynacji podatkowej. Sądy przyznały mu rację: WSA w Krakowie i Naczelny Sąd Administracyjny podtrzymały stanowiska Dyrektora KIS – tylko organ podatkowy może formalnie złożyć takie żądanie do sądu i tym samym zawiesić bieg terminu.
Wyroki Sądu Administracyjnego jednoznacznie wskazują, że sytuacja zawieszenia biegu terminu przedawnienia jest ściśle powiązana z żądaniem organu podatkowego, zgłoszonego w trybie art. 199a § 3 Ordynacji. Czynności prawne podmiotów gospodarczych nie wywierają takich skutków.
Podstawa prawna: Wyrok NSA z 17 lipca 2025 r., sygn. akt I FSK 1913/22
